Здравствуйте.
Перечень оснований для отказа в выдаче патента указан в п.4 ст.346.45 НК:
Цитата:1) несоответствие в заявлении на получение патента вида предпринимательской деятельности перечню видов предпринимательской деятельности, в отношении которых на территории субъекта Российской Федерации в соответствии со статьей 346.43 настоящего Кодекса введена патентная система налогообложения;2) указание срока действия патента, не соответствующего пункту 5 настоящей статьи;3) нарушение условия перехода на патентную систему налогообложения, установленного абзацем вторым пункта 8 настоящей статьи;4) наличие недоимки по налогу, уплачиваемому в связи с применением патентной системы налогообложения.
Согласно ст. 346.45 НК РФ Порядок и условия начала и прекращения применения патентной системы налогообложения.
Цитата:2. Индивидуальный предприниматель подает лично или через представителя, направляет в виде почтового отправления с описью вложения или передает в электронной форме по телекоммуникационным каналам связи заявление на получение патента в налоговый орган по месту жительства не позднее чем за 10 дней до начала применения индивидуальным предпринимателем патентной системы налогообложения. В случае,если индивидуальный предприниматель планирует осуществлять предпринимательскую деятельность на основе патента в субъекте Российской Федерации, в котором не состоит на учете в налоговом органе по месту жительства или в качестве налогоплательщика, применяющего патентную систему налогообложения, указанное заявление подается в любой территориальный налоговый орган этого субъекта Российской Федерации по выбору индивидуального предпринимателя.При отправке заявления на получение патента по почте днем его представления считается дата отправки почтового отправления. При передаче заявления на получение патента по телекоммуникационным каналам связи днем его представления считается дата его отправки
Здесь ничего не сказано о том, что нужно
Цитата: предварительно нужно было подать заявление о постановке на учет предпринимателя, применяющего упрощенную систему налогообложение на основе патента.....и причем только в электронном виде
Выдать патент ФНС обязана в течение 5-ти рабочих дней. Если отказано в выдаче патента, то в течении 5 дней должны уведомить.
Цитата:3. Налоговый орган обязан в течение пяти дней со дня получения заявления на получение патента выдать индивидуальному предпринимателю патент или уведомить его об отказе в выдаче патента.Уведомление об отказе в выдаче патента доводится до сведения индивидуального предпринимателя в течение пяти дней после вынесения решения об отказе в выдаче патента.Уведомление об отказе в выдаче патента выдается индивидуальному предпринимателю под расписку или передается иным способом, свидетельствующим о дате его получения. При отправке уведомления об отказе в выдаче патента по почте заказным письмом такое уведомление считается полученным по истечении шести дней со дня направления заказного письма.
(ст.346.45 НК РФ).
Рекомендуемая форма заявления на получение патента (№26.5-1) (письмо ФНС от 30.11.2012 №ЕД-4-3/20217@)
УСН на основе патента прекратила свое существование с 01.01.2013. Может быть Вы и ФНС не совсем поняли друг друга?